Nat Cell Biol | 再取进展!同济大学张勇/高绍荣/刘文强揭示小鼠早期胚胎发育中潜在印记控制区域的重要作用
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亲本 DNA 甲基化和组蛋白修饰在哺乳动物植入前胚胎中经历了明显的全局重编程,但表观遗传串扰及其对胚胎发生的影响在很大程度上是未知的。
2022年4月28日,同济大学张勇,高绍荣及刘文强(杨绘,柏丹丹,李延鹤及余招伟为论文共同第一作者)共同通讯在Nature Cell Biology(IF=29) 在线发表题为“Allele-specific H3K9me3 and DNA methylation co-marked CpG-rich regions serve as potential imprinting control regions in pre-implantation embryo”的研究论文,该研究全面分析了小鼠植入前胚胎中 DNA 甲基化与 H3K9me3 重编程之间的关联,并揭示具有高 H3K9me3 信号和 DNA 甲基化水平 (CHM) 的富含 CpG 的基因组位点是植入前胚胎发生过程中 DNA 甲基化维持的热点。
该研究进一步分析了等位基因特异性表观遗传图谱,分别以前所未有的分辨率在雌性发育和雄性发育胚胎中,并确定了 1,279 个等位基因特异性 CHM,包括 19 个已知的印记控制区 (ICR)。该研究表明,22 个 ICR 样区域 (ICRLRs) 可能与已知的 ICRs 类似地调节等位基因特异性转录,其中五个被证实对小鼠胚胎发育很重要。总之,该研究揭示了等位基因特异性 CHM 的广泛存在,并在很大程度上扩展了哺乳动物植入前胚胎中等位基因特异性调控的范围。
另外,2022年4月15日,同济大学高绍荣,张勇及高亚威共同通讯在Cell Research 在线发表题为”Dynamic nucleosome organization after fertilization reveals regulatory factors for mouse zygotic genome activation“的研究论文,该研究优化了基于微球菌核酸酶消化的高通量测序 (MNase-seq),以阐明受精后的12 小时内的核小体组织动力学。该研究的数据不仅阐明了受精后雄性和雌性原核中的核小体定位动力学,而且还提供了一种在发育过程中识别关键转录调节因子的有效方法(点击阅读)。
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